2022年3月，智慧农业专业获批，农学院成立智慧农业学系，成为全国设立智慧农业学系的第四个高校。

智慧农业系着眼于国家乡村振兴战略和国家数字化农业战略的需求，依托四川农业大学丰富的科研资源，开展作物生产学、植物生理学、分子生物学，普通遗传学，生物信息学、遥感基础与应用、大数据处理技术、机器学习、人工智能、Python语言及应用、作物生长模拟与应用、精准作物表型组、物联网工程导论、智慧农场规划与设计、作物生产机械化等课程的教学工作；全面培养能将信息技术、生物技术、现代工程技术和现代经营管理知识与农学有机融合的高素质复合型人才。

现有专业课教师20余人，教学科研和社会服务方向以智慧农业为主，涉及作物信息学、农业遥感、作物智能生产加工、设施农业、智能农机、基因组学、分子生物学、生物信息学、作物精准表型育种等现代农业数字化研究领域。